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中文名 N-[12-[((7-硝基-2-1,3-苯并恶二唑-4-基)氨基]十二烷酰基] -D-赤型-鞘氨醇
英文名 N-[1-hydroxy-14-[(4-nitro-2,1,3-benzoxadiazol-7-yl)amino]tetradec-4-en-2-yl]hexadecanamide
英文别名 Dodecanamide, N-[(1S,2R,3E)-2-hydroxy-1-(hydroxymethyl)-3-heptadecen-1-yl]-12-[(7-nitro-2,1,3-benzoxadiazol-4-yl)amino]-
N-[(2S,3R,4E)-1,3-Dihydroxy-4-octadecen-2-yl]-12-[(7-nitro-2,1,3-benzoxadiazol-4-yl)amino]dodecanamide
描述 C12 NBD神经酰胺是神经酰胺的荧光类似物,可作为神经酰胺酶检测的底物[1][2]。
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体外研究 指南(以下是我们推荐的方案。该方案仅提供指南,应根据您的具体需要进行修改)。在本实验中,C12 NBD神经酰胺用作荧光nCDase底物,反应产物将通过反相高效液相色谱分离[2]:1.20µM底物、75 mM NaCl中的1 nM nCDase、25 mM HEPES(pH 8.0)和0.4%Triton X-100,在37°C下,最终体积为100µL,持续2小时。2.用1:1氯仿-甲醇提取样品,在氮气下干燥,并在60µL HPLC流动相B中再次悬浮。使用Spectra 3µm C8SR柱(3μm颗粒,3.0×150 mm)通过反相HPLC分离反应产物。3.流动相A在HPLC级水中含有0.2%甲酸和1mM甲酸铵。流动相B在HPLC级甲醇中含有0.2%甲酸(IL)和1mM甲酸铵。4.基于FRET的分析,使用20µM底物ES.173.cds、50 ng nCDase、75 mM NaCl、15 mM磷酸钠(pH 7.4)和0.3%Triton X-100在96个黑孔板中进行3小时。5.测量共振荧光(Ex=347 nm,Em=430和530 nm)。
参考文献

[1]. Tani M, et al. Specific and sensitive assay for alkaline and neutral ceramidases involving C12-NBD-ceramide. J Biochem. 1999 Apr;125(4):746-9.

[2]. Otsuka Y, et al. Identification of Small-Molecule Inhibitors of Neutral Ceramidase (nCDase) via Target-Based High-Throughput Screening. SLAS Discov. 2021 Jan;26(1):113-121.

密度 1.1±0.1 g/cm3
分子式 C36H61N5O6
分子量 659.899
精确质量 659.462158
PSA 166.33000
LogP 11.44
折射率 1.547
储存条件 -20°C,密闭,干燥