NAI-N3

NAI-N3是新型的RNA酰化试剂,用来进行RNA纯化。

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双功能NAI-N3 SHAPE试剂用于标记活细胞内的所有RNA(或体外重折叠的RNA),以单核苷酸分辨率在靶RNA上产生共价修饰。使用点击化学分离RNA,生物素化并随机片段化至50-100nt的大小。为了产生cDNA测序文库,对RNA片段进行3'-末端修复,衔接子连接,大小选择,生物素富集,逆转录(RT)和PCR。最终结果是对应于NAI-N3处理的样品中的修饰碱基的片段或来自模拟处理样品的背景表达值的选择性扩增。将从NAI-N3-和模拟(DMSO)处理的样品产生的测序读数映射到转录组注释,然后计算鉴定对应于SHAPE修饰的RT停止-并因此在整个转录组中反应核苷酸[1]。

[1]. Flynn RA, et al. Transcriptome-wide interrogation of RNA secondary structure in living cells with icSHAPE. Nat Protoc. 2016 Feb;11(2):273-90.

磺丁基-β-环糊精钠盐 | 环孢霉素A | 2-(3,6-二乙酰氧基-2,7-二氯-9H-氧杂蒽-9-基)苯甲酸 | 1-甲基-4-苯基-1,2,3,6-四氢吡啶盐酸盐 | GW4869 | 乙莫克舍 | (2R,2'R,3R,3'R,4S,4'S,5R,5'R,6S,6'S)-6,6'-硫代双(4-(4-(3-氟苯基)-1H-1,-1H-1,2,3-三唑-1-基)-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,5-二醇) | Mitoquinone甲磺酸盐 | GSK2795039 | CBIC2 | BAPTA-AM | AP20187 | GKT137831 | D-(-)-荧光素 | 单响尾蛇毒蛋白