描述 |
BI-7273 是一种选择性的,细胞透过的 BRD9 抑制剂,IC50 和 Kd 分别为 19 和 0.75 nM;同时对 BRD7 的作用较强,IC50 和 Kd 值分别为 117 nM 和 0.3 nM。
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相关类别 |
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靶点 |
IC50: 19 nM (BRD9), 117 nM (BRD7)[1] Kd: 0.75 nM (BRD9), 0.3 nM (BRD7)[1]
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体外研究 |
BI-7273是一种选择性和细胞渗透性的BRD9抑制剂,IC50和Kd分别为19和0.75 nM;对BRD7也有很高的影响,IC50和Kd分别为117 nM和0.3 nM。 BI-7273对一组激酶如CECR2,BRPF1,BRD1,CREBBP,EP300,FALZ,TAF1(2)和TAF1L(2)也有轻微活性,Kds为8.8 nM,210 nM,2600 nM,8600 nM分别为10000nM,850nM,1000nM和1200nM。 BI-7273(1μM)在U2OS细胞系中有活性。 BI-7273阻断EOL-1细胞增殖,EC50为1400 nM [1]。
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激酶实验 |
His标记的BRD9固定在Biacore NTA芯片的流动池3和4上的密度为2000-4000RU。将碳酸酐酶II以相似的密度固定在流动池2上,并在流动池1上产生空白参比表面。然后将缓冲液转换为测定缓冲液(HBS-P + = 10mM HEPES,pH 7.4,150mM NaCl,0.05) %P20 + 5%DMSO)和芯片在用于Kd测定之前平衡数小时。为了能够校正由DMSO浓度的微小变化引起的本体溶剂折射率的差异,在运行的开始和结束时包括溶剂校正样品。化合物(BI-7273等)以浓度系列(1:1稀释,7种不同浓度)注射,最大浓度比预期的Kd高约10-20倍。浓缩系列在96孔板中制备。在为特定化合物选择的稀释窗口没有适当地包括化合物的Kd的情况下,以优化的起始浓度重复测量。定期包括阳性和阴性对照样品以能够监测测定的性能。 CBS用作碳酸酐酶II的阳性对照,以定期检查参考蛋白的完整性。为了校正排除的体积效应,准备DMSO校准系列,并在每次运行的开始和结束时测量校准样品。确定Kd值并取平均值[1]。
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细胞实验 |
细胞在50μL培养基中生长7天,从500开始,在不同浓度的化合物(BI-7273等)存在下,每孔1000个细胞的384孔板,然后使用细胞通过细胞ATP水平测量活力。滴度发光分析[1]。
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参考文献 |
[1]. Martin LJ, et al. Structure-Based Design of an in Vivo Active Selective BRD9 Inhibitor. J Med Chem. 2016 May 26;59(10):4462-75.
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