描述 |
UNC3866 是一种有效的 CBX7-H3 拮抗剂,IC50 为 66±1.2 nM。
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相关类别 |
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靶点 |
IC50: 66±1.2 nM (CBX7)[1]
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体外研究 |
UNC3866,Polycomb CBX和CDY家族的chromodomains甲基赖氨酸(Kme)读取功能的有效拮抗剂。 UNC3866最有效地结合CBX4和CBX7的chromodomains,每个Kd为100 nM,与其他七个CBX和CDY chromodomains相比具有6-18倍的选择性,同时相对于> 250个其他蛋白质靶标具有高选择性。 UNC3866抑制PC3细胞增殖,这是一种已知的CBX7表型,而甲基化阴性对照化合物UNC4219的作用可忽略不计。 UNC3866是PRC1 chromodomains的有效和细胞活性拮抗剂。 UNC3866是CBX7报道的最有效的配体,Kd为97±2.4 nM。 UNC3866与CBX4等效,与CBX7最相似,而CBX4/6分别对CBX2,-6和-8的选择性分别为18倍,6倍和12倍。此外,UNC3866对CBX4/7的选择性比CDY1高65倍,对CBX4/7的选择性高于CDYL1b和CDYL2的9倍[1]。
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激酶实验 |
UNC3866对G9a,EHMT1,SUV39H1,SUV39H2,SETDB1,SETD8,SUV420H1,SUV420H2,SETD7,MLL1三聚体复合物,MLL3四聚体复合物,EZH2三聚体复合物,PRMT1,PRMT3,PRMT5-MEP50复合物,PRMT6的甲基转移酶活性的影响,通过使用闪烁亲近测定法(SPA)监测氚标记的甲基与肽底物的赖氨酸或精氨酸残基的掺入来评估PRMT7,PRMT8,PRDM9,SETD2,SMYD2,SMYD3,BCDIN3D和DNMT1。测定在含有3H-SAM的20μL反应混合物中进行,底物浓度接近每种酶的Km值。在所有选择性测定中使用三种浓度(1μM,10μM和50μM)的UNC3866。为了停止酶促反应,加入7.5M盐酸胍,然后加入180μL缓冲液(20mM Tris,pH8.0)。将反应混合,然后转移到96孔FlashPlate中。将Flash板中的反应混合物温育1小时,并使用TopCount读板仪测量CPM。对于每个数据集,在没有化合物的情况下的CPM计数被定义为100%活性。在没有酶的情况下,每个数据集中的CPM计数被定义为背景(0%)[1]。
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细胞实验 |
将PC3细胞以200个细胞/孔接种到24孔板中。使细胞粘附过夜。然后将培养基(补充有10%FBS的DMEM)与含有DMSO,UNC3866或UNC4219的新鲜培养基交换。在第三天,用含有DMSO,UNC3866或UNC4219的新鲜培养基更换培养基。对于剂量反应研究,EC50来自六点滴定,范围为100μM至0.4μM的UNC3866或UNC4219。在第0,3或6天,将细胞用冰冷的甲醇固定30秒。并用PBS再水化。用DAPI(0.05μg/ mL)染色细胞核,并使用高含量显微镜进行计数。对于剂量反应研究,将UNC3866-或UNC4219处理的细胞的细胞计数标准化为DMSO处理的细胞的平均细胞计数。使用GraphPad Prism 5 [1]中的“log [抑制剂]与标准化响应 - 可变斜率”方程计算EC50。
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参考文献 |
[1]. Stuckey JI, et al. A cellular chemical probe targeting the chromodomains of Polycomb repressive complex 1. Nat Chem Biol. 2016 Mar;12(3):180-7.
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