描述 |
KU-57788 是一种有效的,选择性的 DNA-PK 抑制剂,IC50 值为 13 nM。
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相关类别 |
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靶点 |
DNA-PK:13 nM (IC50)
CRISPR/Cas9
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体外研究 |
无毒浓度0.3μM的NU7441在用低LET和高LET辐射照射的非小细胞肺癌细胞中诱导放射增敏,并且在照射的细胞中未显示双链断裂修复抑制。 NU7441(3μM)显示持续的γ-H2AX信号显着增加。 NU7441(0.3μM)引起显着的G2/M阻滞和DNA片段化的显着增加,并增强辐照的H1299细胞中的细胞衰老[1]。 NU7441(0.5至10μM)剂量和时间依赖性地抑制肝癌HepG2细胞的生长。 NU7441减少肝癌细胞中的pDNA-PKcs(S2056)蛋白表达。此外,NU7441和60CoγIR的双重治疗会影响DNA损伤的修复[2]。 NU7441在BRD4中是溶剂暴露的,这种抑制剂可归类为I型BRD抑制剂[4]。 NU7441降低了NHEJ的频率,同时提高了Cas9介导的DNA裂解后HDR的发生率[5]。
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体内研究 |
肺癌细胞用低LET和高LET辐射照射,并且在照射的细胞中不显示双链断裂修复抑制。 KU-57788(3μM)显示持续的γ-H2AX信号显着增加。 KU-57788(0.3μM)引起显着的G2/M阻滞和DNA片段化的显着增加并且增强辐射的H1299细胞中的细胞衰老[1]。 KU-57788(0.5至10μM)剂量和时间依赖性地抑制肝癌HepG2细胞的生长。 KU-57788减少肝癌细胞中的pDNA-PKcs(S2056)蛋白表达。此外,KU-57788和60CoγIR的双重治疗会影响DNA损伤的修复[2]。 KU-57788弱抑制BRD4和BRDT,IC50分别为1μM和3.5μM。 KU-57788在BRD4中是溶剂暴露的,这种抑制剂可归类为I型BRD抑制剂[4]。 KU-57788降低了NHEJ的频率,同时提高了Cas9介导的DNA切割后HDR的发生率[5]。
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激酶实验 |
使用StepOnePlus实时PCR系统通过DSF评估化合物对BRD4-1和BRDT-1的抑制活性。纯化的BRD4-1(4μM终浓度; 10 mM HEPES(pH7.5),100 mM NaCl和1 mM DTT)和BRDT-1(4μM终浓度; 50 mM磷酸盐(pH7.4),100 mM在96孔板中一式四份地测定NaCl和1mM DTT。加入抑制剂至终浓度为100μM和2%DMSO。蛋白质热移位染料(1:8000)用作荧光探针,并使用ROX Reporter通道(620nm)测量荧光。通过对热循环仪进行编程以使用0.2℃增量和每增量10秒的温育将温度从25℃升高至99℃来研究蛋白质稳定性。使用Protein Thermal Shift Software(v.1.1)中的Boltzmann方程计算转变曲线/熔化温度(Tm)的拐点。 JQ1(+)和dinaciclib分别用作BRD4-1的强和弱结合物的对照。通过使用DMSO对照孔作为参考来计算ΔTm。
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细胞实验 |
将HepG2细胞(每孔4000个)在96孔板中培养24小时。一旦细胞完成附着,将0.1μM,1μM,5μM和10μM的KU-57788加入培养基中。在KU-57788处理12小时后,将10%CCK-8溶液加入培养基中,并继续培养2小时。通过光谱仪测定OD 450值,并分析结果以测量细胞生长。
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参考文献 |
[1]. Sunada S, et al. Nontoxic concentration of DNA-PK inhibitor NU7441 radio-sensitizes lung tumor cells with little effect on double strand break repair. Cancer Sci. 2016 Sep;107(9):1250-5 [2]. Yang C, et al. NU7441 Enhances the Radiosensitivity of Liver Cancer Cells. Cell Physiol Biochem. 2016;38(5):1897-905 [3]. Hardcastle IR, et al. Discovery of potent chromen-4-one inhibitors of the DNA-dependent protein kinase (DNA-PK) using a small-molecule library approach. J Med Chem. 2005 Dec 1;48(24):7829-46 [4]. Ember SW, et al. The acetyl-lysine binding site of bromodomain-containing protein 4 (BRD4) interacts with diverse kinase inhibitors. ACS Chem Biol. 2014 Feb 25. [5]. Robert F, et al. Pharmacological inhibition of DNA-PK stimulates Cas9-mediated genome editing. Genome Med. 2015 Aug 27;7:93
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